基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱的克柔念珠菌遗传分化研究

目的 在蛋白质水平明确克柔念珠菌的遗传分化特征,建立基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)的不同谱系克柔念珠菌的鉴定方法.方法 选取20株克柔念珠菌,采用MALDI-TOF MS结合分析软件ClinProTools,确定克柔念珠菌不同谱系的质谱标志峰,构建基于遗传算法(GA)的分类模型,用于区分不同谱系的克柔念珠菌菌株,选择25株克柔念珠菌对该模型进行验证.结果 利用20株克柔念珠菌构建的GA分类模型,反映模型正确鉴别能力的识别能力值(RC)为100％,反映模型处理测试谱图变异能力的交叉验证值(CV)为97.89％.25株克柔念珠菌、150张谱图外部验证模型显示其分类能力为95.30％.确定1 3个克柔念珠菌谱系相关的特征峰(m/z 3 971.40、3 136.95、3 427.33、2 405.28、2 996.73、2 913.95、3 376.97、6 736.13、5 819.03、4 045.16、5 869.00、3 618.10及3 946.14),可用于正确区分来自不同谱系的克柔念珠菌.结论 本研究论证并确认了克柔念珠菌的群体遗传分化事件,同时也建立了一种简便而有效的快速谱系分型方法.