海岛地区腹泻病例中诺如病毒基因序列分析

目的：了解海岛地区病毒性腹泻病原中诺如病毒的流行状况，对优势流行株进行基因序列分析。方法对舟山市监测医院疑似病毒性腹泻粪便样本经酶联免疫吸附法（ELISA）筛选轮状病毒，对阴性样本采用逆转录聚合酶链反应（RT -PCR）扩增诺如病毒 RNA 聚合酶与主要衣壳蛋白基因，PCR 扩增产物进行测序反应，序列结果与 GenBank 已公布的序列进行比对，测其同源性；并绘制成系统发生树进行进化分析。结果在35份诺如病毒扩增阳性样本中挑选病毒载量最高的 Hu/Zhejiang/9/2006/CHN 株进行测序，并与 Hunter 株、Farming Hill 株等进行比对并绘制系统发生树。Hu/Zhejiang/9/2006/CHN 株属于诺如病毒 GⅡ-4群，与 Hunter 株和 Lanzhou 株形成的分支较接近，RNA 聚合酶有部分序列与这2株完全相同。结论舟山市（海岛地区）病毒性腹泻病原中存在诺如 GⅡ-4群，采用 GDD 基序分析有利于更好地发现新的变异株的存在，为病毒性腹泻的病原学和基因学研究提供依据。