HMGB1基因SNP位点实时荧光PCR检测方法的建立
China Tropical Medicine（2016）
Abstract
目的 建立基于TaqMan探针实时荧光PCR技术的高迁移率族蛋白1(high mobility group box-1 protein,HMGB1)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)检测方法.方法 收集2014年4月在深圳口岸医院体检的健康人群样本20份,选择HMGB1基因上的2个SNP位点设计常规PCR和实时荧光PCR扩增引物和TaqMan探针,采用基因测序和实时荧光PCR方法对样本进行SNP分型.结果 实时荧光PCR方法SNP分型结果显示,在20份样本中的HMGB1基因rs1412125位点检测到TT基因型11例,CC基因型1例,TC基因型8例;HMGB1基因rs3742305位点检测到GG基因型15例,GC基因型5例,未发现CC基因型.这一结果与基因测序方法结论完全一致.结论 基于TaqMan探针技术的实时荧光PCR方法进行HMGB1基因SNP分型简单、快速、高效,可用于人群大规模样本的SNP筛查,具有广泛应用的价值.
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TaqMan probe,real-time fluorescence PCR,single nucleotide polymorphism,HMGB1 gene
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