JIVE方法在卵巢癌多组学数据整合分析中的应用
Chinese Journal of Health Statistics（2019）
Abstract
目的 引入JIVE方法对多组学数据进行整合分析,并应用于肿瘤分子分型研究.方法 使用TCGA数据库中卵巢癌mRNA和miRNA的组学数据,应用JIVE方法整合分析两个组学数据,提取两不同组学数据的共同特征,然后通过对其具有共同结构的数据做主成分分析,给出卵巢癌miRNA分子分型的结果.结果 经过JIVE方法整合分析后,使miRNA数据具有明显与mRNA相一致的分型结构,从而进一步支持了mRNA的分型结果,同时揭示了两组学之间在组织分子分型上具有一定的调控关系.结论 JIVE方法可以用于提取组学之间存在的共同结构矩阵,从而进行多组学数据的整合分析.
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