分子传播网络技术在艾滋病传播性耐药检测中的应用

Modern Preventive Medicine(2019)

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Abstract
目的 分析凉山州布拖县特木里镇、木尔乡和九都乡(后称“两乡一镇”)艾滋病耐药毒株传播情况,利用分子传播网络技术分析耐药毒株传播来源.方法 采集2017年布拖县两乡一镇新报告未治疗的HIV-1感染者的血浆样本,扩增HIV-1 pol基因区蛋白酶和逆转录酶1.2 kb片段,进行耐药分析,同时应用HyPhy2.2.4与Cytoscape3.6.1软件与凉山州近年接受治疗且耐药患者的序列构建分子网络,分析耐药传播情况.结果 在174份血样中获得119条(68.39%)有效分析序列,13例(10.92%)出现了耐药突变,其中CRF_ 08BC亚型毒株耐药率高于CRF_07BC亚型和C亚型毒株(X2=6.884,P=0.032),地区、年龄、职业、婚姻、文化和传播途径耐药率差异无统计学意义.在11例(84.62%) CRF_07 BC亚型毒株中,3例在分子网络中与治疗患者耐药序列成簇,2例K103N突变,1例Q58E突变,其中1例为家庭内传播,其余2例与成簇序列患者关系不详.结论 布拖县两乡一镇艾滋病耐药率较高,达到中度耐药传播水平,运用分子传播网络技术,能进一步发现新报告耐药患者毒株的传播来源.
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