江西省赣州市17株B型流感病毒HA和NA基因特性分析

目的 了解2008-2015年江西省赣州市B型流感病毒株HA与NA基因变异特征.分析WHO推荐的北半球B型流感病毒疫苗株预防效果,为江西省赣州市B型流感监测和防控提供理论依据.方法 依据全国流感监测技术指南对获得的18份典型流感样病例鼻咽拭子标本的B型流感病毒进行分离和鉴定.对分离合格的17份样品进行核酸提取,通过逆转录PCR及Sanger测序获取流感病毒HA与NA基因序列信息.采用生物信息学方法,获得HA与NA基因的氨基酸序列,并与WHO推荐的北半球B型流感病毒疫苗株进行比对,绘制毒株相关性热图和进化树.结果 与WHO推荐的B型流感病毒疫苗株比较,江西省赣州市17份B型流感病毒在4个HA及8个NA抗原决定簇区域存在多个变异(H＞K,N＞i等),其中抗原决定簇区域131,137,141,144,163,164,165在江西省赣州市收集的病毒株中发生较大变化(3～7个变异).结论 由此推测,WHO推荐疫苗株对江西省赣州市发现的B型流感病毒株的预防效果可能不太理想,需进一步采集本市B型流感病毒样本并对其变异情况进行监测,寻找针对本市新发B型流感病毒的疫苗株.