青海省67份轮状病毒结构蛋白VP7基因分型和分布情况

Modern Preventive Medicine(2018)

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摘要
目的 研究2016-2017年青海地区腹泻患者轮状病毒基因分型及流行病学分布.方法 收集门诊及住院部腹泻的粪便标本238份,采用实时荧光PCR法对轮状病毒A组进行检测,阳性标本进行VP7基因扩增和测序.结果 238份粪便标本中,通过实时荧光PCR检测到轮状病毒A组阳性67份,阳性率为28.15% (67/238);对67份轮状病毒A阳性标本进行VP7蛋白检测和测序,测序后得到29份核苷酸序列,用Clustral X Bootstap NJ Tree软件构件进化树,分析发现2016年3月-2017年12月青海轮状病毒以G9P8型为主,共26株,占89.66% (26/29),G2P4型2株(2/28),G3P8型1株(1/28),轮状病毒腹泻发病高发季节为9-12月,其中以12月份检出最高,占总数的61.19% (41/67).病人以成人为主,成人和5岁以下儿童比例为1.73∶1.结论 2016-2017年青海地区轮状病毒以流行病毒株G9P8型为主.
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