2015-2016年阜阳市柯萨奇病毒A16型分离株VP1区基因特征分析

目的 分析阜阳市柯萨奇病毒A16型(CVA16)分离株VP1区基因特征.方法 将2015-2016年阜阳市手足口病患儿CVA16核酸阳性咽拭子标本,接种RD细胞分离病毒,出现细胞病变后用荧光定量PCR鉴定,鉴定阳性标本用RT?PCR扩增VP1区基因片段并进行核苷酸序列测定.采用Mega 6.06生物软件与国内外CVA16毒株参考序列构建进化树,分析VP1区基因特征.结果 26份CVA16核酸阳性的咽拭子合格标本分离出10株CVA16毒株,阳性率为38.46%;10株病毒VP1区基因亲缘性关系分析表明:2株CVA16毒株为B1a亚型,8株为B1b亚型;B1a亚型毒株和广州2012年的CVA16分离株同源性最高,核苷酸同源性为98.0%,B1b亚型毒株和深圳2013、2014年的分离株同源性最高,核苷酸同源性为99.0%.结论 2015-2016年阜阳市分离的CVA16流行毒株株为B1a亚型、B1b亚型,以B1b亚型为主.