2014年深圳市龙岗区诺如病毒胃肠炎暴发的分子流行病学特征

目的 了解2014年深圳市龙岗区诺如病毒胃肠炎暴发疫情的分子流行病学特征.方法 收集监测期间病毒性胃肠炎暴发疫情患者的肛拭子样本,采用实时荧光定量RT-PCR方法检测诺如病毒核酸,并选择部分阳性样本扩增VP1基因区,阳性产物回收并测序分析.结果 13起暴发疫情共检测标本157份,诺如病毒GⅡ型阳性25份,阳性率为15.9％,未检出诺如病毒GⅠ型.测序获得来自7起疫情的GⅡ型诺如病毒VP1基因序列,5株为GⅡ.4亚型,为新型变异株GⅡ.4_Sydney 2012,2株GⅡ.17亚型,与2014年深圳本地株(KP718662)亲缘关系最近.结论 2014年深圳市龙岗区诺如病毒腹泻暴发的主要型别为GⅡ,并以GⅡ.4为主,流行优势株为GⅡ.4_Sydney 2012.