中山市一起输入性D8基因型麻疹病毒基因特征分析

Journal of Tropical Medicine(2015)

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摘要
目的 对2014年5月由越南回国的女工所感染的麻疹病毒进行基因特征分析.方法 采集病人的急性期咽拭子,通过RT-PCR和基因测序分析N基因碳末端450个核苷酸片段,利用BLASTn对序列进行相似性检索,分析麻疹病毒基因特征,并与参考株及沪191疫苗株进行比对,采用Neighbor-Joining方法构建麻疹核蛋白核苷酸种系进化树.结果 获得1段相应样本N基因碳末端序列,上传至GenBank (KJ994346),该核苷酸序列与越南病毒株(Viet Nam:Ho Chi Minh City-AB928200)序列同源性100%,与WHO参考株(Manchester.UNK/30.94-AF280803)同一谱系,属于D8型,序列同源性为96%,氨基酸同源性为97%,其中产生5个基酸替换,第79位点发生变异,由异亮氨酸替代为苏氨酸,蛋白质极性发生改变,由疏水性变成亲水性.结论 该病例为中山市首次发现的输入性D8型麻疹病毒感染病例.
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关键词
measles virus,N gene,genotype,sequence analysis
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