基于线粒体16S rDNA序列的深圳水库区双脐螺分子鉴定

目的 基于线粒体16S rDNA序列对深圳水库区双脐螺进行分子鉴定.方法 以双脐螺基因组DNA为模板,聚合酶链反应扩增16S rDNA目的基因片段,并以pMD18-T载体克隆后进行序列测定,采用BLAST和MEGA4软件分析序列特征.结果 双脐螺线粒体16S rDNA扩增片段大小约为466 bp;测定序列与GenBank中1株巴西藁杆双脐螺(Biomphalaria straminea,B.straminea)同源性为99％;与3株库恩双脐螺(B.kuhniana)同源性均为98％;与l株中介双脐螺(B.intermedia)和l株双脐螺(B.edisoni)的同源性分别为95％和94％.深圳水库区2株双脐螺与巴西藁杆双脐螺(序列号AY030213.1)的遗传距离为0;基于16S rDNA序列,采用MEGA4软件作系统发生分析,以邻位连接法(NJ)和非加权组平均法(UPGMA)构建的系统发生树,水库区双脐螺与该藁杆双脐螺属于同一个分支.结论 根据16S rDNA序列特征,深圳水库区双脐螺可归类为藁杆双脐螺.