黑龙江省肾综合征出血热患者汉坦病毒分离及分子特征

Chinese Journal of Public Health Management(2018)

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摘要
目的 研究黑龙江省肾综合征出血热(HFRS)患者感染汉坦病毒(HV)的分子特征及其与鼠携带HV的对应关系.方法 从HFRS患者血标本中成功分离到一株HV,编号WCL,对病毒S基因进行扩增和序列分析.结果WCL株S基因全长由1698 nt组成,TA含量丰富,编码N蛋白的ORF起始于37nt,终止于1326 nt,编码的蛋白长429 aa,符合HTN型编码.与HV参考毒株进行比较,WCL与汉滩型(HTN)同源性较高,尤其与黑龙江省黑线姬鼠分离株Bao14同源性最高,与汉城型(SEO)等其他病毒同源性较低,并且WCL的S基因编码的N蛋白氨基酸序列也比较保守.进化树分析表明,WCL位于HTN型病毒所在支系,与Bao14、HTN261处于同一分支并且更接近,同属于H4亚型,体现了一定的地理簇集性.结论 WCL与黑龙江省黑线姬鼠分离株属同一亚型,首次发现有H4亚型病例分布.
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关键词
hemorrhagic fever with renal syndrome,hantavirus,S gene,homology,characterization
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