珠海市男男性行为人群HIV-1感染者原发性耐药基因突变分析

South China Journal of Preventive Medicine(2020)

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Abstract
目的 研究珠海市男男性行为(MSM)人群中未经治疗的HIV-1感染者耐药突变发生和基因亚型分布.方法 采集2011-2016年珠海市386名未经治疗的MSM人群HIV-1抗体阳性血浆标本,提取病毒RNA,采用In-house方法扩增HIV-1 pol基因并进行测序,通过系统进化树和数据库分析基因亚型和耐药情况.结果 共得到309份样本的pol区序列.CRF07_BC(占48.87%,151/309)和CRF01_AE(占32.03%,99/309)重组亚型占主要地位,其次是CRF55_01B亚型(30/309,占9.71%).原发性耐药率为1.29%(4/309),传播性耐药(TDR)相关突变率为15.53%(48/309),30例CRF55_01B亚型中有25例出现TDR相关突变,位点均在非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)的V179E.结论 珠海市MSM人群HIV-1基因亚型以CRF01_AE和CRF07_BC重组亚型为主,其他多种基因亚型共同流行;该人群HIV-1耐药率处于低度水平,应关注复杂的亚型组成、CRF55_01B亚型高占比及大部分携带V179E突变等特点,加强对该人群耐药株的监测.
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