肠道病毒71型杭州分离株H3-TY的基因特征分析

目的 对肠道病毒71型(EV71)杭州株H3-TY的基因特征进行分析并探讨其用于疫苗开发的可能性.方法 利用RT-PCR方法扩增EV71 H3-TY株全基因组并克隆入质粒载体,对克隆基因进行序列测定并拼接为全长序列.其后利用Lasergene及MEGA软件对所获序列与11株中国大陆C4亚型病毒株、中国台湾B型代表株TW和国际标准株(BrCr)进行同源性比较,并进行进化树分析.结果 EV71 H3-TY株属于C4亚型,与其他中国大陆流行株在核苷酸水平的同源性介于94.0％ ～99.0％,氨基酸水平的同源性均高于97％.H3-TY主要抗原位点SP70与其他毒株完全相同,SP55除了与BJ08株及BrCr株略有不同外,与其他毒株也均相同.结论 EV71 H3-TY株与其他国内流行株高度同源,主要抗原位点一致,可用于疫苗开发研究.