安徽省GⅡ.P16-GⅡ.2诺如病毒暴发疫情的基因特征分析

Anhui Journal of Preventive Medicine(2020)

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Abstract
目的 了解2018年安徽省一起感染性胃肠炎暴发疫情的病原学特征.方法 收集2018年10月一起急性胃肠炎病例粪便/舡拭子12份标本,采用Real-time PCR检测诺如病毒GⅡ基因组,阳性标本经RT-PCR扩增聚合酶区和衣壳蛋白区部分基因序列,进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析.结果 12份急性胃肠炎病例标本,荧光PCR检出诺如病毒核酸均为阳性,测序获得10条序列.遗传进化树显示:10条GⅡ.2型间核苷酸序列同源性为100%,与台州参考株GⅡ.2(GenBank登录号:MH806429,MH842206)同源性最高(同源性最高为99.47%),且处于同一分支.结论 此次急性胃肠炎暴发疫情由GⅡ.P16-GⅡ.2诺如病毒引起,鉴于它在中国的广泛流行,应重视GⅡ.P16-GⅡ.2重组株在本地区诺如病毒的监测.
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