丹参SmCPS1基因启动子区甲基化特征分析及其与SmCPS1组织差异性表达的关系

目的:分析不同组织中丹参(Salvia miltiorrhiza)柯巴基焦磷酸合酶1基因(SmCPS1)启动子区甲基化分布特征及其与SmCPS1组织差异性表达的关系.方法:采用重亚硫酸盐转化法检测不同组织中SmCPS1启动子区-1 021 bp (转录起始位点+1)内的甲基化率;实时荧光定量聚合酶链式反应Real-time PCR检测不同组织中SmCPS1表达量.结果:SmCPS1启动子区甲基化主要集中在转录起始位点上游-750 ～ -500 bp, -450 bp以内的启动子区几乎无甲基化.300个甲基化检测位点中,组织差异性甲基化位点共72个,占总检测甲基化位点数的发生甲基化的转录因子结合区域共18个,其中有10个区域的甲基化存在组织差异.与SmCPS1表达量显著相关(P＜0.01)者21个,其中7个负相关者集中在-632 ～ -450 bp,14个正相关者分布在-632 bp之外及-450 bp以内的启动子区.结论:SmCPS1启动子区甲基化差异可能是影响其组织差异性表达的原因.