基于高通量技术的唐古特大黄叶绿体全基因组测序及应用研究
Chinese Traditional and Herbal Drugs(2019)
Abstract
目的 获得野生唐古特大黄叶绿体全基因组信息特征,并对相关物种亲缘关系进行研究.方法 本实验采用Illumina高通量测序技术构建了唐古特大黄叶绿体全基因组图谱.结果 唐古特大黄基因组大小为 161 054bp,大(LSC)、小(SSC)单拷贝区大小分别为 86441 bp和 12745 bp,反向互补重复区(IR)大小为 30934 bp,共注释叶绿体基因132个,包括88个蛋白编码基因,36个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因,其中每个IR区19个.结论 选取唐古特大黄在内的7个蓼科物种、4个其他科物种构建系统发育树,形态极其相似的唐古特大黄与掌叶大黄在分子上亲缘关系也最近,但rpl32等基因存在差异位点,对有效区分近缘物种提供新依据.
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