复发性流产相关基因的生物信息学分析

目的 归纳复发性流产相关基因的文献,并进行生物信息学分析,为进一步的研究和临床治疗提供参考依据.方法 检索CNKI、万方、Pubmed数据库从2005年1月1日-2018年5月30日发表的文献,统计出复发性流产的相关基因,并用DAVID在线数据库对基因进行基因本体论(GO)富集分析、京都基因与基因组百科(KEGG)通路分析,STRING在线数据库构建蛋白-蛋白互作网络图(PPI),Cytoscape 3.7.0软件进行可视化分析.结果 筛选出674篇文献,摘录复发性流产相关基因170个,DAVID不同分类149种,KEGG通路60种,这些基因主要参与炎症反应、免疫应答、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控/负调控、血管生成、T细胞增殖等有关.KEGG通路主要是参与癌症中的蛋白聚糖、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Jak-STAT信号通路、HIF-1信号通路、炎症性肠病、内风湿关节炎等.其中129个参与构建PPI,进一步可视化分析筛选出节点度数排前10的基因:IL6、IL10、VEGFA、TGFβ1、IFNG、TP53、IL1β、STAT3、CCL2、TLR4.结论 所筛选复发性流产的关键基因有助于进一步研究该病的发病机制,同时为药物防治该病提供新的靶点.