基于网络药理学与分子对接法探讨薛氏五叶芦根汤代茶饮防控新型冠状病毒肺炎的作用机理

目的 探讨薛氏五叶芦根汤防控新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的网络作用机制及可行性.方法 在中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)检索下载薛氏五叶芦根汤所有中药的活性成分、作用靶标及分子结构;利用Cytoscape 软件构建成分-靶标网络;将作用靶标导入STRING平台进行蛋白互作分析;借助R软件对靶标进行基因本体(Gene Ontology,GO)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路分析;在RCSB PDB(RCSBProtein Data Bank)数据库中检索获取COVID-19相关靶标的晶体结构,借助AutoDockTool、Vina软件,将受体与配体进行预处理及分子对接.结果 筛选获得中药活性成分57种,作用靶标286个;通过构建成分-靶标网络获得4个核心网络;通过GO富集获得P≤0.05的生物学过程189条,主要涉及肾上腺素能受体活性、G蛋白偶联胺受体活性、核受体活性等;通过KEGG富集获得P≤0.05的信号通路100条,主要涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、乙型肝炎、白介素-17(Interleukin,IL-17)信号通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、人巨细胞病毒感染、流体剪切应力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号途径等;分子对接结果显示所含活性成分与COVID-19相关靶标的结合能均＜-5kcaL/mol(20.9kj/mol).结论 薛氏五叶芦根汤代茶饮的多种活性成分可通过与COVID-19的相关靶标结合,通过多种生物学途径对COVID-19发挥调控作用.