基于计算机虚拟筛选的赤芍抗流感作用物质基础研究

Journal of Chinese Medicinal Materials(2017)

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Abstract
目的:研究赤芍抗流感病毒的作用机制与分子基础,为利用中药赤芍开发出安全有效的抗流感药物提供理论依据.方法:基于计算机虚拟筛选的方法,以单味中药赤芍的119个化学成分为对象,选取5个目前与流感治疗密切相关的靶点蛋白作为受体,采用SYBYL分子对接的方法,以Total Score结合打分为标准筛选出得分最高的分子并观察其MOLCAD展示的与5个流感病毒靶蛋白的表面疏水性和氢键供体与受体区域,借助Discovery Stu-dio 2016软件对其进行相互作用的分析,预测其结合模式及亲和力.结果:通过SYBYL分子对接的方法,观察到赤芍119个成分与流感相关受体分子结合Total Score打分普遍较高,并均超过其与自身配体结合打分,且发现小分子与受体分子结合,可产生多种分子间作用力,使小分子牢固地结合在活性位点.结论:基于计算机虚拟筛选方法中的分子对接技术,发现赤芍具有很好地发挥多靶点抗流感病毒的优势,是一种具有开发潜能的抗流感中药.
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Paeoniae Radix Rubra,Influenza,SYBYL surflex-dock,Multi-target,Chinese Medicine
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