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基于nrDNA ITS序列的不同产地白及遗传多样性研究

Fengming Ren,Juan Bai,Yan Liu, Houqiang Cao, Qingguo Wang, Shengqiang Li

World Science and Technology-Modernization of Traditional Chinese Medicine(2019)

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Abstract
目的 开展不同产地白及遗传多样性研究,为优良品种选育及其资源保护提供依据.方法 采用nrDNA内源转录间隔区(ITS)序列分析35份不同产地白及(白及22份,黄花白及9份,小白及4份)遗传多样性.结果 白及种内遗传距离为0.0163(0-0.0337),种间遗传距离为0.0371(0.0311-0.0441);产地内遗传距离为0.0033(0-0.0077),产地间遗传距离为0.0169(0.0016-0.0301).聚类分析显示,22份不同产地白及样品聚为3个主要的分支,来自同一产地或相邻产地的样品倾向于聚为一支,地理分布越近,亲缘关系往往越近.变异位点分析显示,22份不同产地白及在613个碱基的比对长度内含有44个变异位点,来自安徽的样品分别在第321、350、410位碱基处具有稳定的单碱基变异,来自浙江的样品在129、154、188、451、454处有5个单碱基变异,在432、433、434处有3个碱基的连续突变.结论 ITS序列可以用于白及的遗传多样性分析,不同产地白及亲缘关系与地理分布具有一定相关性,但采用ITS序列不能严格地将不同产地白及样品区分开.通过变异位点分析,能有效鉴定安徽产和浙江产白及.
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