基于数据库挖掘分析RECQL1基因在胃癌中的表达及意义
Heilongjiang Journal of Traditional Chinese Medicine(2020)
Abstract
目的:通过挖掘生物信息学数据库相关数据,分析RECQL1基因在胃癌中的表达、临床意义及作用机制.方法:应用GEPIA数据库探讨RECQL1在胃癌组织中的表达水平,对胃癌患者病理分期及生存预后进行相关性分析;COSMIC和cBioPortal数据库分析RECQL1基因突变情况;String数据库分析与RECQL1相互作用的蛋白网络,并进行富集分析.结果:在胃癌组织中,RECQL1的表达水平显著高于正常组织,RECQL1表达水平与胃癌患者临床病理分期有显著相关性,但与总体生存率无显著相关性.RECQL1突变包括无义替换、错义替换和同义替换等.RECQL1相关蛋白网络主要参与DNA的重组、代谢、修复等生理过程,可能在错配修复、非同源末端连接、DNA复制等信号通路中发挥作用.结论:RECQL1在胃癌组织中高表达,可能参与了胃癌的发生和发展,与胃癌病理分期相关.
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