2016-2017年青海省诺如病毒Ⅱ型基因型流行情况分析

目的 了解2016-2017年青海省诺如病毒Ⅱ型基因型及分子流行病学特点,为全省诺如病毒的防治提供理论基础和实验依据. 方法 用GⅡ型诺如病毒实时荧光PCR试剂盒检测GⅡ型诺如病毒核酸;用GⅡ型诺如病毒特异性引物COG2F/G2-SKR进行RT-PCR扩增,阳性产物回收纯化后直接测序,用Clustal和MEGA4.0生物软件对诺如病毒GⅡ基因序列进行比对和系统进化分析. 结果 不同地区来源的粪便标本238份,实时荧光PCR的方法检测GⅡ阳性标本47份,占19.74％.从47份阳性标本中分离到17株诺如病毒Ⅱ型核酸序列,包括诺如病毒Ⅱ型基因型GⅡ.1(4株)、GⅡ.2(8株)、GⅡ.3(2株)、GⅡ.4(2株)和GⅡ.14(1株),分别占23.53％、47.05％、11.76％、11.76％和5.88％. 结论 青海省流行的诺如病毒GⅡ型存在多种基因型,其中以诺如病毒GⅡ.2型为主,可为诺如病毒的防治提供参考.