2010-2016年唐山市H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征分析

Journal of Parasitic Biology(2017)

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摘要
目的 了解2010-2016年唐山市分离的H3N2亚型流感病毒株血凝素HA基因特征和变异规律. 方法 随机选取2010一2016年唐山市分离的20株H3N2亚流感毒株提取RNA,采用RT-PCR扩增目的片段,测序,采用MEGA 6.0软件构建HA基因核苷酸系统进化树,采用BioEdit v7.2.5软件比较分析其核苷酸序列特征及氨基酸变异情况. 结果 0株病毒HA1区核苷酸和氨基酸同源性分别为92.4%和89.1%.系统进化和序列分析显示,2010-2011流行年度分离的5株病毒分别属于HA基因1和5分支,其中1分支毒株在抗原决定簇发生E50K,I260M,R261Q氨基酸替换,5分支毒株发生D53N、Y94H、I230V和E280A替换;2011-2016流行年度分离的15株H3N2亚型病毒属于3C分支,与疫苗株A/Perth/16/2009比较抗原表位发生S45N、T48I、A198S、N278K和N312S位点突变,并逐年进化为3C.1(2010-2011)、3@2012/13 (2012-2013)、3C.3(2013-2014)、3C.3a (2014-2015)和3C.2a (2015-2016)分支.与相应疫苗株相比,3C.3a和3C.2a分支毒株抗原表位A、B及受体结合部位均发生了氨基酸位点突变,其中3C.2a毒株拥有Q311H(C区)和N171K(D区)位点突变. 结论 2010-2016年唐山市分离株A/H3N2亚型流感病毒发生抗原漂移,未来应关注3C.2a分支流行株的变化.
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关键词
Influenza virus,influenza A virus subtype H3N2,hemagglutinin,genetic characteristics
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