苏州活禽市场禽流感病毒(H7N9)季节变化及HA、NA、PB2基因系统进化分析
Journal of Microbes and Infections(2018)
Abstract
自2013年3月中国首次发现新型禽流感病毒H7N9以来,其于2013—2014年期间发生流行,2015年也有散发性感染.该病毒的流行不仅危及家禽养殖业,还对公共卫生安全造成严重威胁.为调查活禽市场中H7N9的进化史和季节性变化,本研究于2013年7—12月在H7N9主要流行地区之一江苏省苏州市活禽市场采集2655份鸡、鸭咽拭子样本,对样本中流感病毒核酸进行检测.结果显示,冬季样本中H7N9阳性率显著高于夏季样本,同时发现样本中存在H5、H7和H9亚型毒株之间的混合感染.进一步对H7N9阳性样本的HA、NA和PB2基因序列进行分析,结果表明阳性样本中HA、NA和PB2基因序列与新型H7N9病毒的相应基因序列同源,其在家禽体内传代时也在继续进化.特别是一些样品中PB2基因序列与H5N1病毒PB2基因序列的同源性较高.结果提示,苏州存在一种新型H7N9病毒基因重排的可能性,建议在活禽市场对所有禽流感病毒亚型进行持续监控,从而有助于流感病毒的及时防控.
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Key words
Avian influenza virus,H7N9 subtype,Seasonal variation,Phylogenetic tree
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