乳酶生生产用菌种的全基因组序列分析研究

目的 了解我国乳酶生的生产用菌种全基因组分子特征.方法 将乳酶生的生产用菌种屎肠球菌CMCC32901培养后,依次进行形态观察、生化鉴定与16S rRNA基因序列测定,并应用高通量测序技术,对生产用菌种CMCC32901进行全基因组序列测定,分析基因组基本特征、基因功能、同源性及致病性.结果 分析结果显示,发现CMCC32901菌株与NCBI数据库中收录的不同屎肠球菌菌株的16S rRNA基因序列相似度大于99.5％,与其他肠球菌菌株之间的16S rRNA基因序列相似度均大于92.0％.屎肠球菌CMCC32901染色体全基因组序列全长为2394726 bp,平均GC含量为39.1％,共含有2718个基因,其中具有COG功能2059个,参与KEGG代谢通路1402个.同源性分析显示其基因组中编码2589个屎肠球菌特异性蛋白.细菌的致病性预测分析发现在CMCC32901菌株中发现5种对人潜在致病性相关蛋白.结论 首次获得了我国乳酶生生产用菌种——屎肠球菌CMCC32901全基因组的基本特征,为后续乳酶生的生产工艺优化和生产用菌种的质量控制奠定了基础.