诺如病毒疫情暴发的分子流行病学特征

目的 了解深圳市光明新区诺如病毒疫情暴发的病原体基因分型情况和分子流行病学特征.方法 收集2016年12月至2017年3月感染性腹泻暴发疫情患者的肛拭子标本,通过荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测诺如病毒核酸,阳性标本采用巢式PCR扩增诺如病毒VP1基因区(ORF1-ORF2),PCR扩增产物经琼脂糖电泳鉴定后进行测序分析.结果 9起暴发疫情共检测标本101份,诺如病毒阳性标本共54份,总阳性率为53.47％,其中GⅡ型标本52份,GⅠ型标本1份,GⅠ和GⅡ型混合感染标本1份.测序成功获得48份阳性标本GⅡ型诺如病毒V P1基因序列,47份为GⅡ.P16/GⅡ.2亚型,其中45份与2016年中国香港株(KY771081)和中国广东株(KY485113)同源性最高,2份与2017年中国江苏株(KY806301)和2016年泰国清迈株(M F972308)同源性最高;1份为GⅡ.P7/GⅡ.6亚型,与2014年中国台湾株(K M 267741)同源性最高.结论 2017年该区诺如病毒疫情暴发的主要型别为GⅡ型,优势流行株为GⅡ.P16/GⅡ.2亚型.