引起导管相关血流感染的草螺菌属 Herbaspirillum huttiense鉴定及药敏分析

Chinese Journal of Laboratory Medicine(2020)

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摘要
目的:分析导管相关性血流感染草螺菌属的鉴定和药敏试验过程,提高临床医师和微生物检验工作者对罕见病原微生物关注和认知。方法:采集1例慢性肾衰竭血液透析患者经透析导管留取的血培养阳性标本,涂片、染色、镜检,并对分离到单个菌落,分别进行质谱分析、生化鉴定和药敏试验;提取细菌基因组DNA,扩增细菌16S rDNA并测序;细菌基因组高通量测序。结果:血培养瓶孵育20 h后阳性报警,涂片见革兰阴性杆菌。血琼脂上孵育16 h,见乳白色、凸起和无溶血菌落。VITEK2 Compact鉴定为洋葱伯克霍尔德菌,N335药敏卡检测药敏结果,发现该菌对氨曲南和多黏菌素耐药,其余抗生素均敏感。VITEK MS质谱仪临床数据库无法鉴定出种属,VITEK MS科研数据库鉴定为 Herbaspirillum huttiense/Herbaspirillum aquaticum。该菌16S rDNA与草螺菌属 Herbaspirillum huttiense、Herbaspirillum aquaticum一致性均>99%。细菌基因组高通量测序,发现本例临床分离株与Genbank数据库中 Herbaspirillum huttiense subsp putei IAM 15032同源性为100%,证实本例分离株为 Herbaspirillum huttiense。 结论:环境微生物演变成人类病原菌种类不断增多,草螺菌属因其生化特性与其他菌种相似,极易被误鉴定,需引起检验工作者的重视。
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关键词
Catheter-related infections,Bacteremia,Herbaspirillum,Genome, bacterial,High-throughput nucleotide sequencing,Microbial sensitivity tests
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