哈尔滨市男男同性恋HIV-1感染者gag基因分型特征分析

Chinese Journal of Experimental and Clinical Infectious Diseases(Electronic Version)(2017)

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摘要
目的 分析哈尔滨市确诊的男男同性恋(MSM)HIV-1感染病例gag基因序列,确定新发感染毒株基因型.方法 收集2014年7月至12月确诊且未经过抗病毒治疗的感染者抗凝血,分离外周血单个核细胞,从中提取基因组DNA,采用巢式PCR法扩增gag基因.采用MEGA 5.05软件构建gag基因系统发育树,分析基因型特点.结果 共收集49例MSM感染者样本,且均获得gag基因序列.系统发育树显示,49例gag基因主要分布于3个亚型内,其中CRF01_AE亚型39例,占79.6%;B亚型5例,占10.2%;CRF07_BC亚型4例,占8.2%.另外,发现CRF01B重组型1例,占2.0%.在CRF01_AE毒株中,92.3%(36/39)与我国MSM人群参考株成簇,7.7%(3/39)与泰国及我国西南地区异性传播参考株成簇.结论 本研究时间段哈尔滨市确诊MSM感染病例以CRF01_AE基因型为主.MSM人群可能成为本地区复杂基因型的重要来源,实时监测该人群新发感染病例的分子流行病学特征,对制定有效地预防和干预措施非常重要.
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关键词
Human immunodeficiency virus type 1,Men who have sex with men (MSM),Gag gene,Genotype
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