基于转录组测序技术的重症手足口病相关基因研究

目的：应用转录组测序技术（RNA-seq）分析重症手足口病（SHFMD）患者外周血单个核细胞（PBMC）转录组情况，筛选SHFMD相关基因，探讨其发生的可能免疫机制。方法收集2014年5月至8月深圳市第三人民医院收治的重症和轻症手足口病（MHFMD）患儿各5例，以及5例健康体检儿童的外周血，均分离PBMC，采用转录组测序技术筛选显著的差异表达基因（DEGs），并通过实时荧光定量PCR对DEGs进行验证。结果 SHFMD组相对健康对照组共117个DEGs，其中108个基因上调，9个基因下调；SHFMD组相对MHFMD组共26个DEGs，其中14个基因上调，12个基因下调；两组DEGs中共有8个相同基因，其中TNFRSF13C、IL-7R、THBS1和VEGFA下调，S100A8、S100A12、IL-8和IL-1β上调（P均＜0.05）。结论S100A8、S100A12、IL-8、IL-1β、TNFRSF13C、IL-7R、THBS1和VEGFA是SHFMD相关的差异表达基因，可能在SHFMD的发生中起重要作用，有望成为手足口病重症化的预测基因。