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假基因DUXAP8在肝癌中的表达及其临床意义

Journal of Clinical Hepatology(2020)

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Abstract
目的 探讨DUXAP8在肝癌中的表达和临床意义,并探讨可能的作用机制.方法 收集TCGA数据库中截至2019年6月的肝癌表达数据及临床资料,筛选出同时满足在癌组织与癌旁组织差异表达且影响患者预后的lncRNA.分析DUXAP8表达水平与肝癌患者临床病理特征以及预后的相关性.利用GO和KEGG通路富集方法分析与DUXAP8相关的基因生物功能及其可能参与的生物过程.利用STRING数据库和Cytoscape进行蛋白质相互作用分析并筛选关键基因,然后对关键基因的表达量及其预后情况进行分析并进行文献检索分析.肝癌组织和癌旁组织DUXAP8 表达比较采用Wilcoxon秩和检验和Wilcoxon符号秩和检验.不同临床病理特征的患者DUXAP8表达水平比较采用Wilcoxon秩和检验.利用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并采用log-rank检验进行组间比较;采用Cox回归分析预后影响因素. Pearson相关法分析DUXAP8的相关基因.结果 非配对样品及配对样品肝癌组织和癌旁组织中DUXAP8的表达水平存在显著差异(P值均<0. 001),肝癌组织中DUXAP8表达明显升高.在不同年龄、T分期的患者中DUXAP8表达差异显著(P值均<0. 05),年龄≥60岁或T分期等级为T3或T4,DUXAP8表达量较高.单因素分析显示,临床分期、T分期、DUXAP8表达量与患者总生存期相关(P值均<0. 001),多因素Cox回归分析结果显示,临床分期晚[风险比(HR)=1. 648,95%可信区间(95%CI):1. 330~2. 709,P<0. 001]、高DUXAP8表达仍是预后差的独立危险因素( HR=1. 849,95%CI:1. 262~2. 713,P<0. 01). DUXAP8 高表达的样本中,富集了与维持肿瘤细胞的增殖和细胞周期等相关的基因. TOP2A、KIF2C、TTK、PLK1、CDCA8、CDC20、NCAPG、BUB1B、BUB1和CCNA2为DUXAP8相关靶基因的Hub基因,主要参与细胞有丝分裂和细胞周期等过程,是肝癌患者预后不良的相关因素( P值均<0. 05).结论 DUXAP8 高表达是肝癌患者预后不良的危险因素, DUXAP8可能通过影响细胞增殖、周期等过程促进肝癌的发生发展.
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pseudogene duxap8,liver cancer
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