基于GEO数据库对原发性高血压的差异靶基因分析

Journal of Clinical Cardiology(2018)

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摘要
目的:初步探索分析原发性高血压的差异靶基因,为原发性高血压的治疗提供新的靶点.方法:从GEO公共数据库中检索高血压的数据芯片,利用GEO2R在线分析公共的差异表达基因,分别对差异表达基因和预测靶基因进行GO富集分析及KEGG通路分析.结果:①GEO2R在线分析成功筛选出147个差异microRNA,由logFC统一标识后得出16个关键microRNA,其中下调microRNA共3个,上调microRNA共13个.运用Metascape软件对microRNAs富集及KEGG热图分析,同时得出关键microRNA有2个,分别是:mir133a、mir31;②差异microRNA导入mirTarBase后,最终发现共有66个差异预测靶基因,通过David6.7在线分析富集得出关键基因,主要调控细胞内凋亡信号通路对DNA损伤的反应、血管生成、信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正、负调控、细胞膜内陷、蛋白质heterodimerization活动等方面.结论:①利用生物信息学能有效地分析基因芯片数据,获取生物的内在信息,为下一步实验提供有力的证据;②差异microRNA基因表达及预测靶基因的表达主要以信号通路传导方式为基础,这为治疗高血压提供了新的诊疗依据,同时也为后期的靶向治疗奠定了基础.
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