基因芯片筛选ghrelin miRNA转染胰腺炎细胞模型后的差异表达基因

Chinese Journal of Gastroenterology(2020)

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Abstract
背景:前期研究提示ghrelin在急性胰腺炎发病过程中发挥重要作用,但其机制尚不明确.目的:应用基因芯片技术筛选出ghrelin miRNA转染胰腺炎胰腺腺泡细胞后的差异表达基因.方法:以雨蛙肽构建胰腺炎胰腺腺泡细胞模型.将AR42J细胞分为ghrelin miRNA+雨蛙肽组、阴性对照+雨蛙肽组.提取细胞RNA,合成为ds-DNA,与大鼠全基因组基因芯片杂交、扫描、分析.筛选与炎症和钙通路相关的差异表达基因,并采用RT-PCR法对其中3个基因(Bcl-2、caspase-8、caspase-12)进行验证.结果:给予AR42J细胞ghrelin miRNA+雨蛙肽干预后,共筛选出2938个差异表达基因,其中1435个基因表达上调,1503个基因表达下调.与CAMP/Ca2+信号通路相关的差异表达基因有60个,与炎症通路相关的差异表达基因有199个.RT-PCR结果表明,ghrelin miRNA+雨蛙肽组Bcl-2、caspase-12表达下调,caspase-8表达上调,与基因芯片筛查结果一致.结论:基因芯片技术可筛选出ghrelin miRNA转染胰腺炎胰腺腺泡细胞过程中发挥关键作用的基因,从而为研究内源性ghrelin对胰腺炎胰腺腺泡细胞的作用机制提供依据和参考.
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