饶河地区野生动物携带病毒的基因分型及序列特征分析

Chinese Journal of Zoonoses(2020)

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摘要
目的 确定当前饶河地区宿主动物所携带病原体的基因型别,分析其变异情况,对该地区自然宿主动物的感染情况进行监测.方法 使用TRIZOL法提取待测样本RNA,经RT-PCR扩增后对PCR产物进行核苷酸序列测定.应用DNAStar软件包对核苷酸序列进行同源性比较,构建系统进化树和氨基酸序列的比对.结果 在饶河地区,除褐家鼠(Rattus norvegicus)以外,松鼠(Sciurus vulgaris)也携带SEOV.本次从3只褐家鼠和1只松鼠体内分离出汉城型汉坦病毒(Seoul virus,SEOV),4株SEOV的遗传距离范围为0.00~0.01,与黑龙江地区常见SEOV病毒株亲缘关系较近.结论 黑龙江地区的气候和自然地理条件非常适合携带汉坦病毒(HV)宿主动物的生存和繁殖,但是随着人们生活条件的改善,禁止伐木狩猎,家鼠和野鼠与人类交集的逐渐减小,肾综合征出血热(HFRS)在黑龙江省暴发的概率也越来越小.
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