人冠状病毒HKU1N和S蛋白基因序列及进化分析

目的 了解人冠状病毒HCoV HKU1在我国福州急性重症下呼吸道感染患儿中的感染情况以及病毒N基因和S基因的系统进化特征.方法 通过RT-PCR法对2007年11月至2015年1月因呼吸道感染住进医院儿科重症监护病房的266例小儿鼻咽抽取物标本进行4种人冠状病毒的检测和人冠状病毒HCoV-HKU1的确认检测,测序并BLAST比对分析8份人冠状病毒阳性产物.结果 在266例标本中检出2例HCoV-HKU1感染阳性病例,检出率为0.75％(2/266).这两例患儿一例诊断为支气管炎、一例诊断为急性重症肺炎.通过检测都发现混合感染了人副流感病毒3型(HPIV-3).对这两株病毒FZ90和FZ96的N和S蛋白基因进行序列测定、拼接和系统进化分析;结果表明这2株HCoV-HKU1都属于HKU1基因型A.结论 人冠状病毒HCoV-HKU1可能是儿童下呼吸道感染中较为重要的一种病原,混合感染导致儿童病情加重.