宁波野生鼠类携带的沙粒病毒检测和种系进化分析

Chinese Journal of Zoonoses(2015)

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摘要
目的:对宁波地区野生鼠类携带的沙粒病毒进行检测并分析病毒基因序列特征。方法设计沙粒病毒L、S基因的简并引物,采用RT‐PCR方法对宁波口岸捕获的鼠类样品进行沙粒病毒检测,分离病毒,对PCR产物进行测序及系统发生分析。结果共检测73份鼠类样品,其中12份褐家鼠经检测为阳性,分离获得沙粒病毒株DX1401,该病毒株S片段扩增片段大小为413 bp ,L片段扩增大小1204 bp。S片段的系统发生分析显示DX1401与Mobala病毒株ACAR3080位于同一分支,与Mobala病毒株ACAR3080遗传距离最为接近,值为0.467;L片段的系统发生分析显示DX1401与Lassa病毒株Jo‐siah、NL、Z148、Bamba‐R114、Soromba‐R、Nig08‐A37、Nig08‐A47,Mobala病毒株 ACAR3080,Morogoro病毒株13017/2004, Mopeia病毒株Mozambique、AN 21366‐BNI位于同一组,与Mobala病毒株ACAR 3080遗传距离最为接近,值为6.953。结论本研究证实了宁波地区野生鼠类中存在沙粒病毒流行。
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关键词
rodents,arenavirus,detection,phylogenetic analysis
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