5株鼠样品中分离汉坦病毒毒株S基因序列比较与分析
Chinese Journal of Zoonoses（2016）
摘要
目的 了解近年来从宁波口岸捕获的鼠类样品中分离的5个汉坦病毒株遗传学差异.方法 利用RT-PCR方法,对5个汉坦病毒株S基因全长进行扩增、克隆和测序,并将这5个毒株的S基因序列分别与GenBank登录的20个汉坦病毒感毒株进行比较分析.结果 DX1507株和DX1408株S基因核苷酸序列长度为1766 bp与汉城型(SEOV)病毒株Rn-DH27同源性最为接近,LJ1112株S基因核苷酸序列长度为1772 bp与汉城型(SEOV)病毒株Cherwell同源性最为接近,DX0903株和BL1402株S基因核苷酸序列长度为1725 bp与大别山型(DABV)病毒株Yongjia-Nc-95和Yongjia-Nc-38同源性最为接近.结论 宁波口岸分离到的汉坦病毒株分别为汉城型和大别山型,对宁波口岸开展汉坦病毒传播防控有重要意义.
更多关键词
Hantanvirus,Ningbo,sequence analysis,S gene
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