多位点序列分型应用于致病性黄疸出血群钩端螺旋体分析

Chinese Journal of Zoonoses(2015)

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摘要
目的 初步探讨MLST(multilocus sequence typing)分型技术在致病性钩端螺旋体中的应用.方法 对我国3个省份的39株致病性钩端螺旋体黄疸出血群菌株提取DNA,采用7个位点进行PCR扩增、序列测定,应用eBURST和BioNumerics (Version5.10)软件进行分析.结果 39株菌株呈现5个ST型别,ST1为中国三省份中主要的基因型,占53.85%(21/39).eBURST分析显示:39株菌株分为2个Clonal complexes和1个singleton,其中Group1占66.67%(26/39),Group2占20.51%(8/39),一个singleton占12.82% (5/39);BioNumerics软件聚类分析显示:39株菌株分为3个Group,与eBURST分析中的分群结构一致.MLST基因型别具有明显的地域性特征.结论 MLST方法可初步应用于致病性钩端螺旋体分子流行病学、种群结构、亲缘进化关系等研究.
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