家养野猪脑心肌炎病毒的分离、鉴定及全基因组序列分析

目的：分离家养野猪脑心肌炎病毒（Encephalomyocarditis virus ，EMCV），作全基因组序列测定及与相关物种同源性比较。方法用改进的“细胞接种与RT-PCR方法相结合”技术，成功分离到国内首株家养野猪EMCV JZ1202株，并对其全基因组序列进行测定和分子特征分析。结果分离毒的基因组全长为7735 bp ，与国内外不同动物源EMCV参考毒株的核苷酸同源性为81．2％～99．9％，与国内猪源EMCV分离毒的同源性高达99．4％以上。基于EMCV全基因组、ORF和VP1基因序列绘制的系统发育进化树显示，EMCV可分为 G1、G2和G33个群，JZ1202株与其他国内参考毒株同属于G1群。结论结果证实，家养野猪可感染EMCV并引起发病，提醒作野生动物养殖要考虑EMCV的传播；EMCV存在较大的地域差异，在家养野猪和鼠之间可能存在着交叉感染；EMCV在感染家养野猪时可能发生个别氨基酸突变，以适应不同的猪种。