增殖期婴儿血管瘤mRNA表达谱分析及信号网络构建

Chinese Journal of Current Advances in General Surgery(2019)

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Abstract
目的:分析增殖期婴儿血管瘤(IH)mRNA表达谱,并构建增殖期婴儿血管瘤调控的信号通路网络.方法:收集2017年3月—2017年9月西安交通大学第二附属医院小儿外科手术治疗的9例IH患儿手术切除标本,依据分期不同分为增生期组(n=5)和消退期组(n=4),病例均经病理确诊,比较两组mRNA表达谱差异,分析两组差异基因的GO(Gene Ontology)以及两组主要差异基因信号通路变化.结果:通过GO富集分析得出差异基因在基因的分子功能(MF),参与的生物过程(BP)和所处于的细胞组成(CC)三大类信息中的分布,成功构建GO富集功能图;通过KEGG数据库进行Pathway注释,筛选出差异基因、靶基因富集的显著性信号通路,根据信号通路间的关联关系成功构建Pathway之间的信号转导网络.结论:基因芯片方法检测增殖期和消退期mRNA表达谱可成功筛选差异基因,GO富集分析、KEGG数据库注释等生物信息学方法可通过差异基因筛选出显著性信号调控通路,并构建信号转导网络.
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