宏基因组二代测序在诊断颅脑创伤相关中枢神经系统感染中的价值

目的:探讨脑脊液宏基因组二代测序(mNGS)在颅脑创伤(TBI)后中枢神经系统(CNS)感染中的诊断效能与应用价值。方法:前瞻性纳入2018年8月至2020年1月上海交通大学医学院附属仁济医院神经外科高度怀疑存在CNS感染但缺乏病原学结果的TBI患者，采集其脑脊液标本，并行mNGS与微生物培养同步检测。以CNS感染临床诊断为"金标准"，分别计算两种检测方法的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、Youden指数；通过受试者工作特征(ROC)曲线计算曲线下面积，以评估mNGS的诊断效能。结果:行mNGS与微生物培养同步检测的21例TBI患者中，共有11例符合CNS感染临床诊断标准，其中脑室膜炎8例，脑脓肿3例；11例患者中，mNGS阳性9例，微生物培养阳性3例。mNGS与微生物培养的灵敏度分别为81.8%、27.3%，特异度均为90.0%，阳性预测值分别为90.0%、75.0%，阴性预测值分别为81.8%、52.9%，Youden指数分别为0.718、0.173，ROC曲线下面积分别为0.859(95% CI：0.639～0.970)、0.586(95% CI：0.354～0.794)，且与AUC＝0.5的诊断参考线比较，mNGS与其的差异有统计学意义( Z＝4.553， P<0.001)，而微生物培养与其差异无统计学意义( Z＝1.000， P＝0.317)。 结论:对于TBI相关的CNS感染诊断，mNGS较微生物培养具有更好的诊断效能，显示了其应用价值，可作为微生物培养等常规诊断技术的必要补充。