糖尿病肾病患者DNA甲基化表达谱分析

目的:从表观遗传角度探索糖尿病肾病的发病机制. 方法:收集糖尿病肾病、糖尿病非肾病组、正常对照组的肾组织标本,利用全基因组甲基化测序的方法,分析三组样本之间的甲基化差异,结合转录组的相关信息,分析差异甲基化对糖尿病肾病的影响. 结果:糖尿病肾病患者基因组整体CpG甲基化水平明显高于糖尿病非肾病患者;糖尿病肾病患者与糖尿病非肾病患者之间的差异甲基化区域(differentially methylated regions,DMR)数目高于这两组患者与正常对照之间的DMR数目.对DMR关联到的差异基因进行GO和KEGG功能分析,发现这些差异基因主要和局灶黏连有关,其中,整合素相关基因的甲基化水平在糖尿病肾病患者和糖尿病非肾病患者之间均有显著差异.对DMR的甲基化水平和差异表达基因的表达水平之间的相互关系进行分析,发现90个DMR关联到的62个差异基因的甲基化水平和表达水平之间存在负相关. 结论:糖尿病肾病患者存在明显DNA甲基化差异,DNA甲基化在糖尿病肾病发生发展中可能起重要作用.