组蛋白甲基转移酶SETD2在乳腺癌组织的表达及其临床意义
Chinese Journal of Experimental Surgery(2020)
Abstract
目的:利用高通量基因组学及蛋白组学数据集,分析组蛋白甲基转移酶(SETD2)在乳腺癌中的表达及其与临床预后价值。方法:纳入肿瘤蛋白组学数据库(TCPA)、基因预后分析数据库K-M作图及受试者操作特征曲线(ROC)作图数据库乳腺癌相关数据集,根据纳入标准,选择相关数据集分析SETD2的在癌与正常组织,不同分子分型乳腺癌中的表达差异及其基因与蛋白表达差异与乳腺癌临床预后的相关性。结果:SETD2 mRNA在乳腺癌中表达(中位数为878)低于正常组织(中位数为1 073,
P<0.05);在Luminal B型中表达显著低于其他分型(
P<0.05)。SETD2高表达提示较高的乳腺癌的无复发生存[RFS,60个月比42个月,风险比(
HR)=0.76,
P<0.05]和较高的化疗后(pCR) pCR率,尤其在Luminal A型乳腺癌。
结论:SETD2在乳腺癌的中的表达低于正常乳腺组织,并与乳腺癌的化疗效果、生存预后明显相关。
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Key words
SET domain containing 2,Epigenetic,Breast cancer,Bioinformatics,Cancer proteome atlas
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