TRUGENE(R)HIV-1基因型检测系统在HIV-1亚型分析中的应用
WORLD JOURNAL OF INFECTION(2006)
摘要
目的利用TRUGENE(R)HIV-1基因型检测系统对我国部分地区HIV感染者的血浆样本进行耐药性检测的同时进行HIV-1的亚型分析.方法采用TRUGENER HIV-1试剂盒扩增靶HIV-1序列即pol基因中长度分别为297bp的蛋白酶基因片段和621bp的逆转录酶基因片段,采用OpenGeneR DNA测序系统和数据分析软件进行测序和序列分析,利用HIVDatabase网站提供的HIV基因亚型分析软件对所得到的靶序列进行亚型分析.结果对165份标本的靶序列进行扩增和测序全部成功,采用蛋白酶基因片断和反转录酶基因片断进行亚型分析的结果非常吻合,165份标本亚型的分类与分布情况提示目前各类感染人群中的HIV-1毒株的亚型分布特点呈现出多样化和复杂性.另外,发现了一例国内尚未报道过的CRF09-cpxHIV-1的感染.结论TRUGENERHIV-1基因型检测系统可以成功的应用于HIV-1的亚型分析.
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