基于16S rDNA可变区测序技术对抗生素治疗后的6月龄内肺炎婴儿的呼吸道菌群现况调查

目的 观察<6月龄肺炎婴儿的上、下呼吸道菌群状况.方法 纳入2017年1至8月在复旦大学附属儿科医院呼吸科住院的<6月龄的肺炎婴儿,同时收集口咽拭子及支气管肺泡灌洗液(BALF)标本,利用16S rDNA可变区测序技术分析呼吸道菌群结构,比较上、下呼吸道菌群.结果 24例婴儿的口咽拭子和BALF标本进入本文分析.上呼吸道菌群丰度前5位依次是:链球菌属、假单胞菌属、普氏菌属7、韦荣球菌属和埃希氏-志贺菌属,下呼吸道菌群丰度前5位依次是假单胞菌属、链球菌属、普氏菌属7、克雷伯菌属、罗氏菌属.下呼吸道菌群相较于上呼吸道有更多的独有菌,下呼吸道菌群的物种丰富度显著高于上呼吸道,多样性低于上呼吸道(P<0.05).上呼吸道与下呼吸道菌群丰度在前42位的菌属均为共有菌,占上、下呼吸道总细菌的98%以上.链球菌属和假单胞菌属是上、下呼吸道中相对丰度有显著差异的主要菌属.结论 小婴儿肺炎的上、下呼吸道菌群均存在显著改变;上、下呼吸道菌群物种组成相似,物种比例有差异.