基于功能组学数据识别卵巢癌风险microRNA

目的 通过生物信息学与免疫组化实验相结合的方法,探讨新的卵巢癌发病相关microRNA (miRNA).方法 选取2004年1月至2006年3月间哈尔滨医科大学附属第一医院及哈尔滨医科大学附属第三医院收治的70例上皮性卵巢癌手术病例石蜡包埋样本,采用SP免疫组化法进行检测,设阴性对照组及阳性对照组,阳性反应观察采用双盲法.以Gene Ontology为功能组学背景,度量不同基因之间的功能相似性得分,根据得分综合排序,寻找卵巢癌风险miRNA.应用该方法对2 588个miRNA进行优化排序,通过免疫组化实验方法对风险miRNA在卵巢癌中调控位点进行证实.结果 优化后,卵巢癌相关miRNA如miR-200a/b/c排在前列,排序前10位miRNA中的大部分都在正常组织和卵巢癌组织中呈差异表达.miR-125a调控的人表皮生长因子-2(HER-2)呈高表达趋势.HER-2表达水平与临床分期,病理分级及存活时间显著相关,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 miR-125a通过调控HER-2影响卵巢癌的临床病理特征,可成为新的卵巢癌相关风险因子.