基于公共数据库分析GABRD基因在肾透明细胞癌组织中的表达及预后意义

目的:探讨γ-氨基丁酸A受体 δ亚基(GABRD)基因在肾透明细胞癌组织中的表达及预后意义,通过富集分析初步了解GABRD基因在肾透明细胞癌中可能发挥的功能.方法:提取Oncomine和TCGA数据库中有关GABRD基因表达的数据集,进行数据挖掘.筛选GABRD基因在肾透明细胞癌中的关联基因并进行富集分析.结果:Oncomine和TCGA数据库中检索到涉及GABRD基因的研究包含肾透明细胞癌标本75例和正常组织597例.在肾透明细胞癌组织中GABRD mRNA的表达量显著高于正常组织(P<0.01).使用UALCAN网站分析来自TCGA数据库531例肾透明细胞癌患者发现,GABRD高表达的患者总体死亡率较高,而低表达GABRD的患者预后较好(P=0.012).基于UALCAN网站筛选出的GABRD关联基因,富集分析发现这些基因主要涉及血管生成、肌动蛋白着丝过程、细胞连接、对生长因子的反应、小GTP酶介导的信号转导、涉及细胞分化的细胞表型等.结论:GABRD基因在肾透明细胞癌组织中呈现高表达,并与肾透明细胞癌预后相关,其共表达基因参与多个和肿瘤发生进展有关的生物过程,有望成为肾透明细胞癌的治疗靶点.