基因表达谱结合共表达网络分析发现胰腺导管腺癌预后分子机制

目的 结合胰腺导管癌(PDAC)表达谱数据、临床资料以及分析基因共表达网络,定义PDAC预后相关的基因,并挖掘其预后相关的分子调控机制.方法 通过Cox生存分析寻找表达水平与生存时间相关的基因(P＜ 0.000 1).计算得到的相关基因之间的共表达关系,建立共表达网络,进一步寻找网络中核心模块.结果 Cox生存分析得到273个与患者的生存数据相关的候选基因,构建共表达网络[Pearson相关系数(r)＞ 0.9,P＜0.05]寻找核心模块(MCODE算法,得分＞2),最后发现1个包含6个基因(PTMAP7、FTSJ3、TLK2、GOLGA3、PTTG1IP、ZBTB37) 14个共表达关系的核心模块.其中GOLGA3基因已经被发现与PDAC的转移侵染有关;其他基因也都被研究发现属于已知癌基因.结论 构建的PDAC相关基因的共表达模块与PDAC预后相关,且可能作为PDAC预后相关标志分子.