SOX30基因在结直肠癌中的表达与甲基化分析
Carcinogenesis,Teratogenesis & Mutagenesis(2015)
Abstract
目的:探讨新发现的抑癌基因SRY盒包含基因30( SOX30)在结直肠癌中的表达及甲基化变化。方法:用逆转录PCR(RT-PCR)检测结直肠癌细胞株(HCT8、HCT116和SW480)中SOX30 mRNA的表达,利用去甲基化药物5-Aza-CdR处理结直肠癌细胞株72 h后检测SOX30基因高甲基化与其表达调控的关系。应用甲基化特异性PCR(MSP)检测上述3株结直肠癌细胞株及54例结直肠肿瘤组织和10例癌旁组织SOX30基因的甲基化发生情况,通过硫化测序PCR(BSP)验证结直肠癌组织和癌旁组织SOX30基因的甲基化改变,并对甲基化情况与结直肠癌患者病理特征进行相关性分析。结果:SOX30 mRNA在上述3株结直肠癌细胞株中表达与对照组相比均较低,且均发生明显高甲基化;去甲基化药物处理上述3株细胞株后, SOX30 mRNA的表达明显得到恢复。SOX30基因在大部分结直肠癌组织中均呈现高甲基化状态,甲基化发生率为79.6%(43/54);而在相应的癌旁组织中甲基化检出率较低,仅为20%(2/10)。对结直肠癌患者中SOX30基因甲基化与其临床病理学资料进行相关性分析发现,SOX30基因高甲基化与患者的肿瘤病理分型显著相关(P=0.045),而与患者的性别、年龄、吸烟与否、TNM分期和Ducks分期无显著相关性(P均>0.05)。结论:SOX30基因在结直肠癌中发生明显高甲基化修饰改变,其基因表达水平明显下调,而且其甲基化修饰率与患者肿瘤病理分型相关,提示SOX30可能在结直肠癌的发生过程中起重要作用。
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Key words
SOX30,DNA methylation,colorectal cancer,methylation specific PCR,bisulfite squencing PCR
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