非小细胞肺癌TUBB3基因表达调控的生物信息学分析

目的:应用生物信息学的方法研究β-微管蛋白亚型TUBB3在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达及其分子调控机制。方法:通过GEO数据集(GEO profile)、转录因子和miRNA调控关系数据库(TransmiR)、综合型的miRNA靶基因数据库(miRWalk)、转录因子结合位点搜索(ConSite)等，研究TUBB3上游转录因子、共表达基因及与其有相互作用的miRNA等，阐明NSCLC中TUBB3表达的分子调控机制及其可能的作用。结果:TUBB3的启动子存在Snail、n-MYC等多个与NSCLC相关的转录因子结合位点。其在转录后水平受到miR-200家族、miR-342-3p、miR-410等miRNA的调控，这些miRNA与NSCLC的增殖与侵袭有关。TUBB3与HDGF、GMPS、MRPL9、PMAIP1和SLBP有共表达行为，受转录因子Snail共同调控。其中SLBP、PMAIP1及转录因子Snail与细胞周期和细胞凋亡存在一定的联系。结论:NSCLC中TUBB3的表达受到多个层面的调控，其可能参与了细胞周期和凋亡，同时与NSCLC细胞增殖与侵袭存在一定的联系。